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Journal articles
Host range and molecular variability of the sadwavirus dioscorea mosaic associated virus
Marie Umber
1
Denis Filloux
2
Laurence Svanella-Dumas
3
Lydiane Bonheur
4
Isabelle Acina-Mambole
4
Rose-Marie Gomez
1
Chantal Faure
3
Fabiola Anzala
1
Claudie Pavis
1
Philippe Roumagnac
2, 5
Armelle Marais
3
Sébastien Theil
3
Thierry Candresse
3
Pierre-Yves Teycheney
6, 5, *
*
Corresponding author
Marie Umber 1
Author
Denis Filloux 2
Author
Laurence Svanella-Dumas 3
Author
Lydiane Bonheur 4
Author
Isabelle Acina-Mambole 4
Author
Rose-Marie Gomez 1
Author
Chantal Faure 3
Author
Fabiola Anzala 1
Author
Claudie Pavis 1
Author
Philippe Roumagnac 2, 5
Author
Armelle Marais 3
Author IdHAL : armelle-marais ORCID : https://orcid.org/0000-0003-2482-1543
Sébastien Theil 3
Author
Thierry T. Candresse 3
Author Employer institution : Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement IdHAL : thierry-candresse ORCID : https://orcid.org/0000-0001-9757-1835
Pierre-Yves Teycheney 6, 5
Correspondent author ORCID : https://orcid.org/0000-0002-9754-0745
1
ASTRO - Agrosystèmes tropicaux (INRAE Domaine Duclos Petit-Bourg F-97170 Guadeloupe - France)
2
UMR PHIM - Plant Health Institute of Montpellier (CIRAD Campus International de Baillarguet TA A-54/K
34398 Montpellier
- France)
- Cirad - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement : UMR 120 (Siège 42, rue Scheffer 75116 Paris - France)
- IRD - Institut de Recherche pour le Développement (Siège Le Sextant 44, bd de Dunkerque CS 90009 13572 Marseille cedex 02 - France)
- UM - Université de Montpellier (163 rue Auguste Broussonnet - 34090 Montpellier - France)
- INRAE - Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement : UMR0385 (France)
- Institut Agro Montpellier (2, place Viala - Montpellier - France)
3
BFP - Biologie du fruit et pathologie (Centre INRAE Bordeaux-Aquitaine 71 avenue Bourlaux BP81 F-33883 Villenave d'Ornon - France)
- UB - Université de Bordeaux (35, place Pey Berland - 33076 Bordeaux - France)
- INRAE - Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement : UMR1332 (France)
4
UMR AGAP - Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (TA A-108 / 03 - Avenue Agropolis - 34398 Montpellier Cedex 5 France - France)
- Cirad - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement : UMR108 (Siège 42, rue Scheffer 75116 Paris - France)
- INRAE - Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (France)
- Institut Agro Montpellier (2, place Viala - Montpellier - France)
5
Cirad-BIOS - Département Systèmes Biologiques (Avenue Agropolis TA A-DIR / 04 34398 Montpellier Cedex 5 France - France)
- Cirad - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Siège 42, rue Scheffer 75116 Paris - France)
6
UMR PVBMT - Peuplements végétaux et bioagresseurs en milieu tropical (Faculté des Sciences et techniques - Université de La Réunion 15 avenue René Cassin CS92003 97744 Saint-Denis Cédex 9 pour le Cirad Station de Ligne-Paradis - 7 chemin de l'IRAT - 97410 Saint-Pierre - Réunion)
- Cirad - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement : UMR53 (Siège 42, rue Scheffer 75116 Paris - France)
- IRD - Institut de Recherche pour le Développement (Siège Le Sextant 44, bd de Dunkerque CS 90009 13572 Marseille cedex 02 - France)
- UR - Université de La Réunion : UMRC53 (15, avenue René Cassin - CS92003 -97744 Saint Denis Cedex 9 - Réunion)
- INRAE - Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement : USC1424 (France)
Abstract : Dioscorea mosaic associated virus (DMaV) is a member of the genus Sadwavirus, family Secoviridae, that is associated with mosaic symptoms in Dioscorea rotundata in Brazil. The genome of a DMaV isolate detected in D. trifida in Guadeloupe was sequenced by high-throughput sequencing. Using an RT-PCR-based detection assay, we found that DMaV infects D. alata, D. bulbifera, D. cayenensis-rotundata, D. esculenta, and D. trifida accessions conserved in Guadeloupe and Côte d’Ivoire and displays a very high level of molecular diversity in a relatively small region of the genome targeted by the assay. We also provide evidence that DMaV is also present in D. rotundata in Benin and in D. alata in Nigeria.
Mots-clés :
virus phytopathogène
Document type :
Journal articles
Complete list of metadata
https://hal.univ-reunion.fr/hal-03565882
Contributor : Réunion Univ Connect in order to contact the contributor
Submitted on : Friday, February 11, 2022 - 11:39:53 AM
Last modification on : Saturday, May 21, 2022 - 3:51:54 AM
Contributor : Réunion Univ Connect in order to contact the contributor
Submitted on : Friday, February 11, 2022 - 11:39:53 AM
Last modification on : Saturday, May 21, 2022 - 3:51:54 AM
Identifiers
- HAL Id : hal-03565882, version 1
- DOI : 10.1007/s00705-022-05379-w
- PUBMED : 35107668
- WOS : 000749980000001
Collections
UNIV-REUNION | AFRIQ | CIRAD | UNIV-MONTPELLIER | INRAE | ANR | BFP
Citation
Marie Umber, Denis Filloux, Laurence Svanella-Dumas, Lydiane Bonheur, Isabelle Acina-Mambole, et al.. Host range and molecular variability of the sadwavirus dioscorea mosaic associated virus. Archives of Virology, Springer Verlag, In press, 167, pp.917-922. ⟨10.1007/s00705-022-05379-w⟩. ⟨hal-03565882⟩
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